ΠΕΡΙΟΧΕΣ ΙΔΙΑΙΤΕΡΟΥ ΑΙΣΘΗΤΙΚΟΥ ΚΑΛΛΟΥΣ ΚΑΙ ΟΙΚΟΛΟΓΙΚΗΣ ΑΞΙΑΣ
Παραλιακή ζώνη μεταξύ Παλαιόχωρας και Σούγιας.
Παραλιακή ζώνη μεταξύ Παλαιόχωρας και Κουντούρας.
Ακρωτήρι και όρμος Γραμμένου. Δάσος με κέδρους και αρμυρίκια.
Φαράγγια Σαμαριάς, Ανύδρων, Αγίας Ειρήνης, Καλογήρου, Τοπολίων κ.α.
Δάση Κουστογέρακου-Επανοχωρίου, Ομαλού.
Περιοχές οικισμού Αζωγυρέ.
Βλάστηση αειφύλλων πλατύφυλλων, θαμνότοποι (μακκίαι) σε μεγάλες εκτάσεις στις θέσεις μεταξύ Βουτά-Σαρακίνας-Μυλωνών-Πλεμενιανών-Στροβλών κ.λπ.
Σπήλαιο Αγίας Σοφίας με σταλακτίτες και σταλαγμίτες στα Τοπόλια.
ΦΑΡΑΓΓΙΑ
Σαμαριάς, Ανύδρων, Αγίας Ειρήνης, Καλογήρου, Τοπολιανό, Καμπάνου, Πρίνε.
ΠΕΡΙΟΧΕΣ NATURA 2000:
Παραλιακή ζώνη μεταξύ ακρωτηρίου Κριού και Ελαφονήσου.
Ελαφόνησος. Η περίφημη παραλία με τη ροζ άμμο και τα σπάνια κρινάκια και το μοναδικό στο κόσμο δάσος από οξυκεδρο.
Παραλιακή ζώνη μεταξύ παραλίας Γιαλισκάρι και Λισσού
Ορεινή ζώνη στα ΒΔ όρια του δήμου με ενδιαφέρον παρατηρητήριο αρπακτικών στον Αι Δίκαιο
Οι Ελληνικές Περιοχές του Κοινοτικού Δικτύου Natura 2000
Το Δίκτυο Natura 2000 αποτελεί ένα Ευρωπαϊκό Οικολογικό Δίκτυο περιοχών, οι οποίες φιλοξενούν φυσικούς τύπους οικοτόπων και οικοτόπους ειδών που είναι σημαντικοί σε ευρωπαϊκο επίπεδο. Αποτελείται από δύο κατηγορίες περιοχών: Τις «Ζώνες Ειδικής Προστασίας (ΖΕΠ)» για την Ορνιθοπανίδα, και τους «Τόπους Κοινοτικής Σημασίας (ΤΚΣ)».
Ο κατάλογος των Τόπων Κοινοτικής Σημασίας όσον αφορά την Μεσογειακή ζώνη, στην οποία ανήκει εξ ολοκλήρου η Ελλάδα, οριστικοποιήθηκε και δημοσιεύθηκε στην επίσημη Εφημερίδα των Ευρωπαϊκών Κοινοτήτων, τεύχος με αριθμό L259 vol.49 21/9/06